1. 忍者联军与晓组织的终极对决
在650集之后，忍者联军与晓组织之间的终极战斗成为核心线索。这场战斗不仅关乎鸣人等人能否击败宇智波带土，还涉及到第四次忍界大战的核心问题——查克拉之祖大筒木辉夜的封印。鸣人、佐助等忍者需要联合起来，对抗被复活的辉夜及其追随者。
2. 鸣人与佐助的最终决战
鸣人与佐助的关系一直是《火影忍者》的重要情感线之一。在650集之后，两人之间的关系达到了顶点，他们不仅要共同面对强大的敌人，还需要解决彼此之间的误会和矛盾。这场决战不仅是力量的较量，更是信念与意志的碰撞。
3. 查克拉之祖的封印
大筒木辉夜的复活是整个故事的高潮部分。为了彻底结束这场旷日持久的战争，鸣人和佐助联手施展了“六道螺旋手里剑”，成功将辉夜封印。这一段剧情不仅展现了角色的成长与牺牲精神，也揭示了忍者世界的起源和终结。
4. 和平的重建
在辉夜被封印后，忍者世界逐渐恢复平静。鸣人继承了历代火影的精神，致力于建设一个没有战争的未来。这一部分的剧情虽然看似轻松，但深刻体现了作者岸本齐史对于和平与希望的追求。
这些主线情节构成了《火影忍者》650集后的核心故事框架，为这部经典动漫画上了圆满的句号。通过这些情节的发展，观众不仅能感受到紧张刺激的战斗场面，还能体会到角色之间深厚的情感纽带和成长历程。
